La academia Cross alberga entre sus alumnos dos grupos muy distintos: La clase diurna, humanos comunes y corrientes, y la clase nocturna, vampiros poderosos y apuestos que toman clases de noche. Yuuki Cross, hija adoptiva del director, es la encargada de mantener el orden y la paz en esta difícil convivencia. Además debe elegir entre Zero, el muchacho que cerció con ella hace mucho tiempo y odia a los vampiros, y Kaname Kuran, un vampiro que le salvó la vida hace mucho tiempo. Pero parece que tanto los vampiros como Zero esconden más de un secreto...